Galvenā atšķirība starp failu sistēmu un datu bāzi ir tā, ka failu sistēma pārvalda tikai fizisko piekļuvi, bet datu bāze - gan fizisko, gan loģisko piekļuvi datiem.
Datu bāzes un failu sistēma ir divas metodes, kas palīdz saglabāt, izgūt, pārvaldīt un manipulēt ar datiem. Abas sistēmas ļauj lietotājam līdzīgi strādāt ar datiem. Failu sistēma ir neapstrādātu datu failu kolekcija, kas glabājas cietajā diskā, savukārt datu bāze ir paredzēta lielu datu apjomu ērtai organizēšanai, glabāšanai un izgūšanai. Citiem vārdiem sakot, datu bāzē ir organizētu datu kopa, kas parasti ir digitālā formā vienam vai vairākiem lietotājiem. Saīsinājums no datu bāzes ir DB. Ir iespējams klasificēt DB pēc to satura, piemēram, dokumenta teksta, bibliogrāfiskā un statistiskā. Ir svarīgi atzīmēt, ka pat datubāzē dati galu galā vai fiziski tiek glabāti dažos failos.
