Galvenā atšķirība starp makro un mikro aļģēm ir tā, ka makro aļģes ir lieli un daudzšūnu ūdens fotosintētiski augiem līdzīgi organismi, savukārt mikro aļģes ir mazi un vienšūnu ūdens fotosintētiski augiem līdzīgi organismi.
Aļģes ir lieli polifilēti, fotosintētiski organismi, kas satur daudzveidīgu sugu grupu. Tās svārstās no vienšūņu mikro aļģēm, piemēram, Chlorella, līdz daudzšūnu makro aļģēm, piemēram, milzu brūnaļģes un brūnās aļģes. Tās galvenokārt ir ūdens un autotrofas. Viņiem trūkst stomātu, ksilēma un flīma, kas sastopami sauszemes augos.
