Galvenā atšķirība starp pirmo un otro kurjera sistēmu ir tāda, ka pirmā kurjera sistēma attiecas uz ārpusšūnu signālmolekulām, bet otrā kurjersistēma attiecas uz intracelulārajām signālmolekulām.
Pirmais un otrais kurjersistēmas sastāv no dažāda veida signālu molekulām. Pirmie kurjeri ir ārpusšūnu molekulas, bieži hormoni vai neirotransmiteri. Turpretī otrie kurjeri ir intracelulāras molekulas, kas pārraida signālus no šūnu membrānas receptoriem uz šūnā esošajiem mērķiem. Šūnu signalizācijas process sākas, kad signālmolekula (ligands) saistās ar šūnas receptoru. Šī saistīšanās maina receptora intracelulāro domēnu, kas izraisa intracelulāros signālu ceļus.
