Galvenā atšķirība starp Apicomplexia un Ciliophora ir tā, ka Apicomplexia ir vienšūņu apakšdzīvnieks un tajā ietilpst organismi ar apikālo kompleksu, savukārt Ciliophora ir vēl viens vienšūņu apakšputns, kurā ietilpst organismi ar blakstiņām.
Vienšūņi ir viena no divām lielākajām grupām, kas pieder valstībai Protista. Otra grupa ir aļģes. Vienšūņi ir vienšūnas dzīvnieki, piemēram, eikariotu organismi. Viņi pieder četrām klasēm: Sarcodina (amēbas), Ciliophora (ciliates), Zoomastigophora (flagellates) un Apicomplexa. Apikompleksijai piemīt struktūra, kas pazīstama kā apikāls komplekss, savukārt Ciliophora locekļiem uz organisma virsmas ir tūkstošiem ciliju.
