Galvenā atšķirība starp atomiem un daļiņām ir tā, ka atomi ir mazas vienības, kas izgatavotas no vairākām daļiņām, savukārt daļiņas ir nelielas vielas daļas.
Atoms ir mazākā vienība no visām matērijām. Agrāk cilvēki domāja, ka atoms ir mazākais, kas pastāv, un mēs nevaram to tālāk sadalīt. Bet saskaņā ar jaunākajiem pētījumu pētījumiem atoms ir izgatavots no vairākām mazām daļiņām, ko sauc par subatomiskām daļiņām. Tomēr termins daļiņa ķīmijā attiecas uz jebkuru nelielu lokalizētu objektu, kuram ir tādas fizikālas īpašības kā tilpums, blīvums un masa.