Galvenā atšķirība starp mezenhimālajām un hematopoētiskajām cilmes šūnām ir tā, ka mezenhimālās cilmes šūnas var diferencēties neironu, kaulu, skrimšļu, muskuļu un tauku audu šūnās, savukārt asinsrades cilmes šūnas var diferencēties visos mūsu ķermeņa asins šūnās.
Cilmes šūnas ir nediferencētas vai nespecializētas šūnas, kas atrodas mūsu ķermenī. Viņi spēj sadalīt un dot tāda paša veida cilmes šūnas vai diferencēties specializētās šūnās audos, kuriem ir noteiktas funkcijas. Sakarā ar šīm ievērojamajām cilmes šūnu spējām tās tiek izmantotas bojāto audu atjaunošanā un atjaunošanā. Mesenchymal cilmes šūnas un hematopoētiskās cilmes šūnas ir divu veidu cilmes šūnas, kurām ir ārkārtīgi liela nozīme. Mesenchimālās cilmes šūnas (nehematopoētiskās cilmes šūnas) ir daudzspēcīgas cilmes šūnas, kas var radīt kaulu, skrimšļu un tauku šūnas. No otras puses, hematopoētiskās cilmes šūnas organismā var veidot visu veidu asins šūnas. Turklāt abi šie cilmes šūnu veidi atrodas kaulu smadzenēs.
