Galvenā atšķirība starp sekretīnu un holecistokinīnu ir tā, ka sekretīns ir peptīdu hormons, ko ražo divpadsmitpirkstu zarnas un tukšās zarnas S šūnas, savukārt holecistokinīns ir vēl viens peptīda hormons, ko izdala divpadsmitpirkstu zarnas I šūnas.
Hormoni ir ķīmiskas vielas, ko sintezē endokrīnās dziedzeri. Viņi regulē lielāko daļu ķermeņa funkciju. Turklāt dažāda veida orgāni izdala dažādus hormonus. Starp dažādiem orgānu veidiem kuņģa-zarnu trakts ir orgāns, kas izdala hormonus, kas ir būtiski pārtikas gremošanai, un ar to saistītās funkcijas. Dažādas GI trakta daļas izdala arī hormonus. Turklāt divpadsmitpirkstu zarnā izdalās arī vairāki būtiski hormoni. Starp tiem sekretīns un holecistokinīns ir divi hormoni, kas tiek ražoti un izdalīti, kad pārtika nonāk kuņģī. Abi hormoni ir peptīdu hormoni, kas ir atbildīgi par kuņģa sekrēciju regulēšanu un sārmainas vides uzturēšanu divpadsmitpirkstu zarnas saturā.