Galvenā atšķirība starp cikloheksānu no cikloheksēna ir tā, ka cikloheksāns ir piesātināts ogļūdeņradis, savukārt cikloheksēns ir nepiesātināts ogļūdeņradis.
Ir dažādi organisko savienojumu veidi, kas izgatavoti, savienojot dažādus elementus ar oglekļa atomiem. Cikloheksāns un cikloheksēns ir ogļūdeņraži, kas sastāv tikai no oglekļa un ūdeņraža atomiem. Ogļūdeņraži ir divos veidos kā aromātiskie un alifātiskie ogļūdeņraži. Turklāt mēs tos varam klasificēt kā piesātinātos (alkānus) un nepiesātinātos (alkēnus un alkīnus) ogļūdeņražus. Visas saites starp oglekļa atomiem un ūdeņražiem ir atsevišķas saites piesātinātajos ogļūdeņražos, savukārt nepiesātinātās formās starp oglekļa atomiem ir divkāršas vai trīskāršas saites.