Galvenā atšķirība starp kaperoniem un kaperonīniem ir tā, ka kaperoni veic plašu funkciju klāstu, ieskaitot olbaltumvielu locīšanu un noārdīšanos, palīdzību olbaltumvielu salikšanā utt., Savukārt šaperonīnu galvenā funkcija ir palīdzēt lielo olbaltumvielu molekulu locīšanā.
Molekulārie chaperoni vai chaperones ir olbaltumvielu molekulas, kas palīdz olbaltumvielu salocīšanas procesā sarežģītās struktūrās. Tādēļ kaperonīni ir šaperona veids, kas ietver siltuma šoka olbaltumvielas. No visiem šaperonu veidiem kaperonīni ir visplašāk pētītie proteīni, ņemot vērā svarīgo lomu, kāda tam ir pareizas olbaltumvielu locīšanas laikā. Tādēļ chaperones un chaperonins darbība novērš neatgriezenisku olbaltumvielu agregāciju un tādējādi ļauj tām funkcionēt. Šaperoni un kaperonīni atšķiras precīzi, pamatojoties uz abu molekulu funkcionalitāti.
