Galvenā atšķirība starp R un S konfigurāciju ir tāda, ka R konfigurācija ir R izomēra telpiskais izvietojums, kuram relatīvais prioritārā secība ir pulksteņrādītāja kustības virzienā, savukārt S konfigurācija ir S izomēra telpiskā izkārtojums, kuram ir relatīvais prioritārā virziens. pasūtīt pretēji pulksteņrādītāja virzienam. Šeit relatīvais prioritātes secības virziens ir aizstājēju prioritāšu dilstošā secība.
R un S izomēri ir organiskas molekulas ar kirālu centru, kas ir oglekļa atoms, kuram ir pievienoti četri dažādi aizvietotāji. Šie aizstājēji tiek uzskaitīti atbilstoši to prioritātei (prioritāte tiek noteikta, izmantojot turpmāk aprakstītos CIP noteikumus).
