Galvenā atšķirība starp kluso un neitrālo mutāciju ir tāda, ka klusā mutācija ir īpašs neitrālas mutācijas veids, kam nav novērojamas ietekmes uz organisma fenotipu, savukārt neitrālā mutācija ir izmaiņas DNS secībā, kas nav nedz labvēlīga, nedz kaitīga organisms izdzīvot un vairoties.
Mutācija ir izmaiņas, kas notiek DNS nukleotīdu secībā. Mutācija var notikt tādu vides faktoru dēļ kā cigarešu dūmi un UV gaisma vai vīrusu uzbrukumu, spēcīgu ķīmisku vielu utt. Dēļ. Dzimumšūnu šūnu mutācijas pāriet nākamajās paaudzēs, savukārt nepārveidojošo šūnu mutācijas (somatiskās mutācijas) nepāriet nākamajās paaudzēs, un tie ietekmēs viena organisma izdzīvošanu. Klusās mutācijas neizraisa izmaiņas kodētā proteīna aminoskābju secībā. Neitrālas mutācijas nerada novērojamu ietekmi uz organisma fenotipu.
