Galvenā atšķirība starp gēnu ekspresiju un gēnu regulēšanu ir tāda, ka gēnu ekspresija ir process, kas no gēnā paslēptas ģenētiskās informācijas ražo funkcionālu olbaltumvielu vai RNS, savukārt gēnu regulēšana ir process, kas izraisa vai nomāc gēna ekspresiju.
Gēns ir īpašs DNS fragments, kas atrodas hromosomā. Tas sastāv no introniem, kas nav kodējošas sekvences, un eksoniem, kas ir kodējošas sekvences. Gēnu izpausme notiek divos galvenajos posmos, lai iegūtu olbaltumvielas. Konkrētā nukleotīdu kārtība nosaka iegūto olbaltumvielu. Tāpēc ir ļoti svarīgi izteikt un regulēt gēnus, lai novērstu nevajadzīgu olbaltumvielu veidošanos, kas var izraisīt dažādas problēmas, tostarp ģenētiskus traucējumus, sindromus utt. Tādējādi gēnu ekspresija un gēnu regulēšana ir divi ārkārtīgi svarīgi procesi, kas notiek dzīvajos organismos. Tomēr neviens no šiem procesiem nenotiek atsevišķi; abi procesi notiek vienlaicīgi.
